669 sayılı Olağanüstü Hal Kapsamında Bazı Tedbirler Alınması ve Milli Savunma Üniversitesi Kurulması ile Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun Hükmünde Kararname (KHK) Türkiye Büyük Millet Meclisi (TBMM) Genel Kurulunda kabul edildi.
OHAL kapsamında çıkarılan KHK ile subay yetiştiren askeri okulları kapanırken, aynı amaçla yeni bir üniversite daha kurulmuş oldu. Milli Savunma Bakanlığı bünyesinde kurulan bu üniversitenin adı “Milli Savunma Üniversitesi” oldu. Üniversite, rektörlüğe bağlı olarak, kurmay subay yetiştirmek ve lisansüstü eğitim vermek amacıyla yeni kurulan enstitülerden kara, deniz ve hava harp okullarından, astsubay meslek yüksekokullarından oluşacak.
5 Ekim 2016’da Resmi Gazete’de yayımlanan karara göre Cumhurbaşkanı Recep Tayyip Erdoğan, üniversitenin rektörlüğüne Prof. Dr. Erhan Afyoncu’yu atadı.
